Berikut ini adalah daftar Pondok Pesantren di daerah Jakarta Utara. Untuk melihat list (daftar) Pondok Pesantren di daerah Anda, silakan klik tautan Daftar Ponpes se-Nusantara.
| Nama Pondok Pesantren | Alamat | Kecamatan |
|---|---|---|
| Pondok Pesantren Al Muhajirin | Telukgong Kavling Blok A 20 | Penjaringan |
| Pondok Pesantren Darul Ghufron | Jl. Luar Batang 5 | Penjaringan |
| Pondok Pesantren Fathul Huda | Jl. Kapuk Kamal Raya No.20 | Penjaringan |
| Pondok Pesantren Nurul Bahri | Muara Angke Rt.006/01 | Penjaringan |
| Pondok Pesantren Al Qur'an Ibrohimiyyah | Kp. Bahari 4 No.121 | Tanjung Priok |
| Pondok Pesantren Ilmu Al Qur'an Al Misbah | JL. Re Mardinata Rt.08/13 | Tanjung Priok |
| Pondok Pesantren YAPIS Al Oesmaniyah | Jl. Tawes No.21-22 | Tanjung Priok |
| Pondok Pesantren Al Mutaqin | Jl. Lontar 2 No.12/14/16 | Koja |
| Pondok Pesantren Yatim Al Aqsha | Jl. Sutra Ungu Blok D6 No.31 | Kelapa Gading |
| Pondok Pesantren Al Hikmah | Jl. Malaka Bulak 18 | Cilincing |
| Pondok Pesantren Al Miftahiyyah | Jl. Muara Gedung Kalibaru | Cilincing |
| Pondok Pesantren Al Wathoniyah 43 | Jl. Raya Rorotan Rt.001/10 | Cilincing |
| Pondok Pesantren Syawapifiyyah Malaka | Jl. Malaka 4 No.27 Rt.013/06 | Cilincing |
Silakan berkontribusi untuk melengkapi daftar pesantren di daerah Anda. Silakan tulis di komentar atau kirim email ke list[at]ponpes[dot]net.